Ustroj Ministarstva
Formalna podjela Ministarstva na uprave te pripadne odjele i odsjeke sa specificiranim djelokrugom rada.
- Kabinet ministra
- Samostalna služba za informiranje i međunarodnu suradnju
- Samostalni odjel za unutarnju reviziju
- Tajništvo Ministarstva
- Uprava za medicinske poslove
- Služba zdravstvene zaštite
- Odjel za izvanbolničku zdravstvenu zaštitu
- Odjel za bolničku zdravstvenu zaštitu
- Odjel programa posebne zdravstvene zaštite i transplantacije
- Odjel za projekte i programe
- Odjel za lijekove i medicinske proizvode
- Odjel za nacionalne liste čekanja
- Odjel za pripremu i provedbu zdravstvenih programa i projekata Europske unije
- Služba za inspekcijske poslove
- Služba zdravstvene zaštite
- Uprava za financijsko poslovanje
- Uprava za pravne poslove
- Uprava za sanitarnu inspekciju
- Služba državne sanitarne inspekcije
- Odjel za predmete opće uporabe
- Odjel za zaštitu od zračenja
- Odjel za hranu
- Odjel za kemikalije
- Odjel za genetski modificirane organizme
- Odjel projekata i programa Europske unije i međunarodnih organizacija
- Odjel za upravni nadzor i drugostupanjski postupak
- Odjel za upravno-pravne poslove i stručnu pomoć
- Služba granične sanitarne inspekcije
- Služba županijske sanitarne inspekcije
- Služba državne sanitarne inspekcije
- Uprava za socijalnu skrb
- Služba za socijalnu skrb
- Služba za pravne poslove, upravni i inspekcijski nadzor
- Služba za razvoj sustava socijalne skrbi
- Odjel za razvoj, standarde, normative i metodološke centre
- Odjel za evidencije, statistiku i analitičke poslove
- Odjel za humanitarnu pomoć i suradnju s organizacijama civilnog društva
- Odjel za pripremu i provedbu programa Europske unije
- Odjel za pripremu i provedbu projekata Europske unije na području socijalnih uključivanja
- Uprava za zaštitu žrtava i sudionika rata